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宏基因組Hi-C(Metagenomic Hi-C)


技術(shù)簡(jiǎn)介:

宏基因組學(xué)是研究微生物群落的有效工具,通常用“binning”的方法,將組裝得到的contigs分箱到每個(gè)菌株中。但是該種方法由于群落中GC含量、覆蓋度一致的菌很多,所以容易引入污染。同時(shí)由于質(zhì)粒的拷貝數(shù)與核基因組不一致,質(zhì)粒很難被分箱到正確的菌株中。近年來(lái)通過(guò)Hi-C技術(shù)能夠有效的解決上述問(wèn)題,其原理如下:

圖片 1.png


應(yīng)用場(chǎng)景:


圖片 2.png








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