Linking the resistome and plasmidome to the microbiome
Hi-C將耐藥基因組和質(zhì)粒基因組與宿主微生物基因組關(guān)聯(lián)
期刊:The ISME Journal(IF:10.3)
時間:2019.5.30
主要內(nèi)容primary coverage
研究者構(gòu)建了兩類廢水樣本,1份不做處理命名為WW,1份添加了E. coli,該菌株含有多重耐藥質(zhì)粒命名為WWEC。兩份樣本分別進行宏基因組和Hi-C分析,Hi-C數(shù)據(jù)分別將2份樣本的宏基因組組裝的contigs聚類得到1000個以上clusters,其中分別有51(WW)和38(WWEC)個clusters的組裝完整性高于80%,Hi-C數(shù)據(jù)能夠重現(xiàn)多重耐藥質(zhì)粒與其宿主間的關(guān)系。