原文題目： Comparative analysis of long noncoding RNAs in angiosperms and characterization of long noncoding RNAs in response to heat stress in Chinese cabbage
雜志信息：Horticulture Research，2021（IF：6.7）
樣品選擇：不同熱處理階段的大白菜
測序策略：lncRNA測序+mRNA測序
重要意義：通過鑒定參與大白菜高溫脅迫相關的lncRNA及其靶基因，為全面理解白菜耐熱機理，特別是lncRNA介導的基因調節機理提供了理論基礎
主要內容和結論：
· 該研究以大白菜基因組測序材料‘Chiifu-401-42’為試材，對不同熱處理階段的大白菜進行lncRNA測序，共鑒定得到了1229個響應熱脅迫的lncRNA
· 隨著熱處理時間的延長，響應熱脅迫的lncRNA數目逐漸增加，且在各個處理階段上調表達的lncRNA數目均多于下調表達的lncRNA
· 對這些熱響應的lncRNA進行全基因組靶基因預測發現，445個lncRNA可通過反式作用調節1544個基因的表達，1027個lncRNA可順式調節2651個基因
· 這些靶基因在“內質網蛋白加工”和“植物激素信號轉導”途徑中顯著豐富。其中，29和22個lncRNA分別參與調控熱響應蛋白HSP和ABA受體PYL基因的表達
大白菜 LncRNA及其反式調控mRNA之間的相互作用
