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文章題目:MeRIP-seq 和 RNA-seq的聯合分析解析急性髓系白血病致癌機制

原文題目:FTO plays on oncogenic Role in acute myeloid leukemia as  a N6-methyladenosine RNA demethylase

期刊及發表時間:cancer cell,2017

主要內容:

    FTO作為一個m6A去甲基化酶,在急性髓系白血病(AML)中發揮重要的致癌作用。FTO在t(11q23)/ MLL-重排、t(15;17)/PML-RARA、FLT3-ITD和NPM1突變的AMLs中高表達。

      FTO可以增強白血病癌基因介導的細胞轉化和白血病發生,通過降低這些mRNA轉錄物中的m6A水平來調節靶基因的表達,如ASB2和RARA,從而抑制全反式維甲酸(ATRA)誘導的AML細胞分化。


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案例2:

中文題目:MeRIP-seq 和 RNA-seq以及蛋白質組學的聯合分析解析

原文題目:Refined RIP-seqprotocalfor epitranscriptomeanalysis with low input materials

期刊及發表時間:PLOS,2018

主要內容:

        對2個肺腺癌患者腫瘤的m6A數據、RNA-seq數據和MS數據進行聯合分析,確定了18個m6A水平存在差異、mRNA和蛋白水平變化不一致的基因。在腫瘤1中,與ACOT2、PARP9、ALG2和SLC2A1等多個基因的蛋白水平相比,其蛋白水平顯著上調。同時發現腫瘤2中一些基因的蛋白質水平,如MYL9、VIM和CST3,相對于mRNA水平顯著下調,所以m6A修飾在很大程度上可以解釋mRNA和蛋白質水平之間的不一致性,是值得進一步探索的研究方向。


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